1973年，人类意外地发现，在完全没有阳光的深海热泉口旁与管虫共生的细菌旺盛地生活着，有些是我们至今所知最古老的物种，意味着这里可能是远古时期生命起源的地方。本片内容将在海怪号以及水螅号两艘潜艇的带领下，深入海底与世隔绝的地方，探访远古时期生命起源的所在。首先潜艇将带领我们下潜600公尺深海域，进入永远处于黑暗中的世界，全程追踪观察地球上最大肉食动物抹香鲸，追捕地球上最大无脊椎动物大王鱿鱼等难得一见的精彩猎食过程。接着潜艇更将带领我们下潜超过1500公尺深的海底，在水温接近冰点及潜艇表面承受压力超过每平方公分218公斤下，惊险进入海底热泉喷口严峻环境处，饱览超热海水由海底裂缝涌出的惊险画面，以及一旁大型管虫、热泉蟹等等颠覆传统思维的生态体系，这些都是世人从未见过的景像。最后，潜艇巧遇抹香鲸追捕大王鱿鱼群，在一阵惊险混乱碰撞中，潜艇船长实时起动自动快速上升情景中，惊险结束刺激的深海潜航之旅程。

1999年除夕夜，堀上笃志（堂本刚饰）却心情灰暗，求职失败，在家里又和父亲起了严重的冲突，他跑到电影院看一部叫（失物森林）的老电影。突然间，胸口一阵激痛，笃志因突发心脏病而倒地而死。死去的笃志竟穿越回...

本篇故事承接前作《格桑花开的时候》，江若婷（郑岚饰）作为老师责任越来越重，面临的考验也越发升级。她不仅遇到老司机（修睿饰）的不断骚扰，还有金主爸爸（赵亮饰）提出的两难选择，老顽童郭爷爷（马德华饰）的多次整蛊，笨贼（李昆鹰饰）对善款的虎视眈眈……象征幸福的格桑花能否陪伴江老师度过重重难关呢？